OSDN Git Service

Merge remote-tracking branch 'refs/remotes/origin/master' v2.4.18p0369
authorTakuo Yasunaga <yasunaga@phys.kyutech.ac.jp>
Sat, 19 Nov 2022 21:42:29 +0000 (06:42 +0900)
committerTakuo Yasunaga <yasunaga@phys.kyutech.ac.jp>
Sat, 19 Nov 2022 21:42:29 +0000 (06:42 +0900)
 Conflicts:
src/Tools/Integration/imagesView/src/imagesView.html
src/Tools/llData/llDataPrint/src/llDataPrint.html
src/Tools/mrcImage/mrcImageConvolution/src/mrcImageConvolution.html
src/Tools/pdbUtil/pdb2mrc2d/src/pdb2mrc2d.html
src/Tools/pdbUtil/pdb2mrc2dWithCTF/src/pdb2mrc2dWithCTF.html
src/Tools/pdbUtil/pdbChargeFit/src/pdbChargeFit.html
src/Tools/pdbUtil/pdbCrystalCreate/src/pdbCrystalCreate.html
src/Tools/pdbUtil/pdbHelix/src/pdbHelix.html
src/Tools/pdbUtil/pdbMatrixCreate/src/pdbMatrixCreate.html
src/Tools/pdbUtil/pdbPCA/src/pdbPCA.html
src/Tools/pdbUtil/pdbRotation/src/pdbRotation.html
src/Tools/pdbUtil/pdbShapeFit/src/pdbShapeFit.html
src/Tools/pdbUtil/pdbTwoProteinFit/src/pdbTwoProteinFit.html

 It looks like you may be committing a merge.
 If this is not correct, please remove the file
.git/MERGE_HEAD
 and try again.

 Please enter the commit message for your changes. Lines starting
 with '#' will be ignored, and an empty message aborts the commit.
 On branch master
 Your branch and 'origin/master' have diverged,
 and have 4 and 2 different commits each, respectively.
   (use "git pull" to merge the remote branch into yours)

 All conflicts fixed but you are still merging.

 Changes to be committed:
modified:   src/Tools/Integration/imagesView/src/imagesView.html
modified:   src/Tools/llData/llDataPrint/src/llDataPrint.html
modified:   src/Tools/mrcImage/mrcImageConvolution/src/mrcImageConvolution.html
modified:   src/Tools/mrcImage/mrcImageNormalizing/src/mrcImageNormalizing.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdb2mrc2d/src/pdb2mrc2d.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdb2mrc2dWithCTF/src/pdb2mrc2dWithCTF.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdbChargeFit/src/pdbChargeFit.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdbCrystalCreate/src/pdbCrystalCreate.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdbHelix/src/pdbHelix.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdbMatrixCreate/src/pdbMatrixCreate.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdbPCA/src/pdbPCA.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdbRotation/src/pdbRotation.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdbShapeFit/src/pdbShapeFit.html
modified:   src/Tools/pdbUtil/pdbTwoProteinFit/src/pdbTwoProteinFit.html

13 files changed:
1  2 
src/Tools/Integration/imagesView/src/imagesView.html
src/Tools/llData/llDataPrint/src/llDataPrint.html
src/Tools/mrcImage/mrcImageConvolution/src/mrcImageConvolution.html
src/Tools/pdbUtil/pdb2mrc2d/src/pdb2mrc2d.html
src/Tools/pdbUtil/pdb2mrc2dWithCTF/src/pdb2mrc2dWithCTF.html
src/Tools/pdbUtil/pdbChargeFit/src/pdbChargeFit.html
src/Tools/pdbUtil/pdbCrystalCreate/src/pdbCrystalCreate.html
src/Tools/pdbUtil/pdbHelix/src/pdbHelix.html
src/Tools/pdbUtil/pdbMatrixCreate/src/pdbMatrixCreate.html
src/Tools/pdbUtil/pdbPCA/src/pdbPCA.html
src/Tools/pdbUtil/pdbRotation/src/pdbRotation.html
src/Tools/pdbUtil/pdbShapeFit/src/pdbShapeFit.html
src/Tools/pdbUtil/pdbTwoProteinFit/src/pdbTwoProteinFit.html

@@@ -1,3 -1,4 +1,7 @@@
+ <<<<<<< HEAD
++=======
++<<<<<<< HEAD
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
  <HTML>
  <HEAD>
  <TITLE>imagesView</TITLE>
@@@ -17,3 -18,6 +21,9 @@@ This command for viewing images with a 
  </PRE>
  </BODY>
  </HTML>
++<<<<<<< HEAD
++=======
+ =======
+ /bin/bash: imagesView: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,3 -1,4 +1,7 @@@
+ <<<<<<< HEAD
++=======
++<<<<<<< HEAD
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
  <HTML>
  <HEAD>
  <TITLE>llDataPrint</TITLE>
@@@ -20,3 -21,6 +24,9 @@@ Options
  </PRE>
  </BODY>
  </HTML>
++<<<<<<< HEAD
++=======
+ =======
+ /bin/bash: llDataPrint: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,34 +1,38 @@@
+ <<<<<<< HEAD
 +/bin/bash: mrcImageConvolution: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
++<<<<<<< HEAD
+ <HTML>
+ <HEAD>
+ <TITLE>mrcImageConvolution</TITLE>
+ </HEAD>
+ <BODY>
+ <H1>mrcImageConvolution</H1>
+ <H2>Usage</H2>
+ <PRE>
+ Usage: mrcImageConvolution
+ Options:
+     [-i[nput]            In                  (NULL      ).as(inFile              ) ] :Essential :Input: mrcImage
+     [-i[nput]k[ernal]a[rray]InKernelArray       (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :Input: Array
+     [-i[nput]k[ernal]m[rc]InKernelMRC         (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :Input: mrcImage
+     [-o[utput]           Out                 (NULL      ).as(outFile             ) ] :Essential :OutputDataFile
+     [-times              times               (1         ).as(Integer             ) ] :Optional  :Repeat time
+     [-c[onfig]           configFile          (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :ConfigurationFile
+     [-m[ode]             mode                (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :Mode
+ ----- Additional Usage -----
+ >>> Array Format under Eos. 'nvalue' indicates the number of values in one line, in usual case, nvalue=N0. If so, you need not define nvalue.<<<<
+ ndim N0 N1 N2 ... [nvalue]
+ data(0,   0,   0,...,        0) data(1,   0,   0,...,        0) data(2,   0,   0,...,        0) ... data(N0-1,   0,   0,...,        0)
+ data(0,   1,   0,...,        0) data(1,   1,   0,...,        0) data(2,   1,   0,...,        0) ... data(N0-1,   1,   0,...,        0)
+ ..............................................................
+ data(0,N1-1,   0,...,        0) data(1,N1-1,   0,...,        0) data(2,N1-1,   0,...,        0) ... data(N0-1,N1-1,   0,...,        0)
+ data(0,   0,   1,...,        0) data(1,   0,   1,...,        0) data(2,   0,   1,...,        0) ... data(N0-1,   0,   1,...,        0)
+ ..............................................................
+ data(0,N1-1,N2-1,...,Nndim-1-1) data(1,N1-1,N2-1,...,Nndim-1-1) data(2,N1-1,N2-1,...,Nndim-1-1) ... data(N0-1,N1-1,N2-1,...,Nndim-1-1)
+ </PRE>
+ </BODY>
+ </HTML>
+ =======
+ /bin/bash: mrcImageConvolution: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdb2mrc2d: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdb2mrc2d: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdb2mrc2d: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdb2mrc2dWithCTF: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdb2mrc2dWithCTF: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdb2mrc2dWithCTF: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdbChargeFit: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdbChargeFit: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdbChargeFit: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdbCrystalCreate: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdbCrystalCreate: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdbCrystalCreate: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdbHelix: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdbHelix: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdbHelix: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdbMatrixCreate: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdbMatrixCreate: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdbMatrixCreate: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdbPCA: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdbPCA: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdbPCA: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdbRotation: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdbRotation: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdbRotation: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdbShapeFit: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdbShapeFit: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdbShapeFit: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master
@@@ -1,1 -1,5 +1,9 @@@
+ <<<<<<< HEAD
  /bin/bash: pdbTwoProteinFit: そのようなファイルやディレクトリはありません
+ =======
++<<<<<<< HEAD
++/bin/bash: pdbTwoProteinFit: そのようなファイルやディレクトリはありません
++=======
+ /bin/bash: pdbTwoProteinFit: No such file or directory
+ >>>>>>> dfe085c4a1f53fa8551dc522aacbdc9dc53598aa
++>>>>>>> refs/remotes/origin/master