gcc/testsuite/go.test/test/bench/reverse-complement.c

   1 /*
   2 Redistribution and use in source and binary forms, with or without
   3 modification, are permitted provided that the following conditions are met:
   4
   5     * Redistributions of source code must retain the above copyright
   6     notice, this list of conditions and the following disclaimer.
   7
   8     * Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
   9     notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
  10     documentation and/or other materials provided with the distribution.
  11
  12     * Neither the name of "The Computer Language Benchmarks Game" nor the
  13     name of "The Computer Language Shootout Benchmarks" nor the names of
  14     its contributors may be used to endorse or promote products derived
  15     from this software without specific prior written permission.
  16
  17 THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS "AS IS"
  18 AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
  19 IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
  20 ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE COPYRIGHT OWNER OR CONTRIBUTORS BE
  21 LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR
  22 CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF
  23 SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS
  24 INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN
  25 CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE)
  26 ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE
  27 POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
  28 */
  29
  30 /*
  31  * The Computer Language Benchmarks Game
  32  * http://shootout.alioth.debian.org
  33  *
  34  * contributed by Bob W
  35  */
  36
  37 #include <stdio.h>
  38 #include <stdlib.h>
  39
  40 #define JBFSIZE 82      // line input buffer size
  41 #define QBFSIZE 5200     // output buffer initial size
  42 #define Z16     "\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0"
  43 #define V32     "\0TVGH\0\0CD\0\0M\0KN\0\0\0YSA\0BW\0R\0\0\0\0\0\0"
  44 #define VALL    Z16 Z16 Z16 Z16 V32 V32 Z16 Z16 Z16 Z16 Z16 Z16 Z16 Z16
  45
  46 int errex(char *s, int n) {      // error message+value, return 1
  47   fprintf(stderr,"\n*** Error: %s [%d]!\n", s, n);
  48   return 1;
  49 }
  50
  51 int main () {                    // ***** main *****
  52   char *pj, *pq, *pr;            // buffer pointers: inp,out,/out
  53   char *jjj = malloc(JBFSIZE);   // allocate input line buffer
  54   char *qqq = malloc(QBFSIZE);   // output buffer (dyn. size)
  55   char *pqstop = qqq+QBFSIZE;    // end-of-buffer pointer
  56   char xtab[256] = VALL;         // char conversion table
  57
  58   if (!jjj || !qqq)
  59     return errex("Buffer allocation", !jjj + !qqq);
  60   pj = fgets(jjj,JBFSIZE,stdin);         // fetch 1st line
  61   if (!pj)
  62     return errex("No input data",0);
  63   if (*jjj != '>')
  64     return errex("1st char not '>'", 0);
  65
  66   while (pj) {                           // MAIN LOOP: process data
  67     fputs(jjj, stdout);                  // output ID line
  68
  69     for (pq=qqq+1, pr=pqstop; ; pq++) {  // LOOP: fill output buffer
  70       pj = fgets(jjj, JBFSIZE, stdin);   // get line from stdin
  71       if (!pj || (*jjj=='>'))  break;    // EOF or new ID line
  72       if (pr <= (pq+61)) {               // need to resize buffer
  73         char *newstop = pqstop + 12777888;
  74         char *newptr  = realloc(qqq, newstop-qqq);
  75         if (!newptr)
  76           return errex("Out of memory", 0);
  77         if (newptr != qqq) {             // new base: adj. pointers
  78           size_t x = newptr-qqq;         // offset for pointer update
  79           pq+=x;  pr+=x;  qqq+=x;
  80           newstop+=x;  pqstop+=x;
  81         }
  82         pr = __builtin_memmove(newstop-(pqstop-pr), pr, pqstop-pr);
  83         pqstop = newstop;                // buffer resize complete
  84       }
  85       while (*pj) {                      // LOOP: conv. & revert line
  86         char c = xtab[(unsigned char)(*pj++)];
  87         if (c)                           // conversion valid
  88           *(--pr) = c;
  89       }
  90     }
  91
  92     for (pq = qqq; pr<pqstop; ) {        // LOOP: format output
  93       size_t x = (pqstop-pr)<60 ? pqstop-pr : 60;
  94       __builtin_memmove(pq,pr,x);        // move line to free space
  95       pr+=x;  pq+=x;  *(pq++) = 0xA;     // adjust pointers, add LF
  96     }
  97     fwrite(qqq, 1, pq-qqq, stdout);      // output converted data
  98   }
  99   return 0;
 100 }