src/sov.h

   1 /*-----------------------------------------------------------
   2 /
   3 /   Program:      sov.c
   4 /
   5 /   Secondary structure prediction accuracy evaluation
   6 /
   7 /   SOV (Segment OVerlap) measure
   8 /
   9 /   Copyright by Adam Zemla (11/16/1996)
  10 /   Email: adamz@llnl.gov
  11 /
  12 /------------------------------------------------------------
  13 /
  14 /   modified by A.R. Kinjo (21/02/2005)
  15 /
  16 /------------------------------------------------------------*/
  17
  18 #include <stdio.h>
  19 #include <stdlib.h>
  20 #include <string.h>
  21 #include <math.h>
  22
  23 #include "blast.h"
  24
  25 #define MAXRES   MAXSEQ
  26
  27 typedef struct {
  28   int     input;
  29   int     order;
  30   int     q3_what;
  31   int     sov_what;
  32   int     sov_method;
  33   double   sov_delta;
  34   double   sov_delta_s;
  35   int     sov_out;
  36 } sov_t;
  37